A implantação do SP Sem Papel será feita em três ondas. A primeira, prevista para ocorrer até o final de agosto, contemplará as Secretarias de Governo, Fazenda e Planejamento, Educação, Saúde, Desenvolvimento Regional, Casa Civil e também a Prodesp.
A segunda onda acontecerá entre setembro e dezembro de 2019 e incluirá todas as demais Secretarias do Governo do Estado de São Paulo. Por fim, a terceira onda de implantação, em 2020, será voltada para a administração indireta.
